Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
NOTOA8MTQ0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTOA8MTQ0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms