Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms