Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEMP2A6NFY4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms