Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MEIS3P1A6NDR6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms