Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF6Q9Y4K3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF6Q9Y4K3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF6Q9Y4K3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF6Q9Y4K3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF6Q9Y4K3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF6Q9Y4K3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF6Q9Y4K3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms