Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CAB39Q9Y376 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAB39Q9Y376 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms