Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SHOC2Q9UQ13 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms