Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHF8Q9UPP1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF8Q9UPP1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms