Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms