Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY5

LPAR3, Lysophosphatidic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR3Q9UBY5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LPAR3Q9UBY5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms