Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRBP1Q9P2E9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RRBP1Q9P2E9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms