Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCNIP1Q9NZI2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP1Q9NZI2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms