Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TREX1Q9NSU2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms