Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STRN4Q9NRL3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STRN4Q9NRL3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms