Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPJQ9HC77 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPJQ9HC77 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms