Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms