Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms