Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
REPIN1Q9BWE0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REPIN1Q9BWE0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms