Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TUBB2BQ9BVA1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TUBB2BQ9BVA1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms