Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KATNB1Q9BVA0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms