Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAF4Q9BUZ4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms