Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD1Q9BUP0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms