Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC38A2Q96QD8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms