Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLRP3Q96P20 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLRP3Q96P20 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms