Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM227BQ96M60 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM227BQ96M60 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms