Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms