Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAMD8Q96LT4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms