Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF185Q96GF1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms