Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LTV1Q96GA3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTV1Q96GA3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms