Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms