Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FAT3Q8TDW7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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