Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL11Q8NHH1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms