Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms