Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CARMIL3Q8ND23 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms