Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC84Q86UT8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms