Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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