Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM47EQ6ZV65 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM47EQ6ZV65 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms