Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUSD1Q6UWL2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms