Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C16orf54Q6UWD8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms