Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.596e-7■■■■■ 31.4
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PRPF8Q6P2Q9 ETFA-206ENST00000559075 1735 ntTSL 217.3■□□□□ 0.368e-11■■■■■ 31.4
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PRPF8Q6P2Q9 TOR1AIP1-208ENST00000528443 3685 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 31.4
PRPF8Q6P2Q9 TOR1AIP1-206ENST00000527391 593 ntTSL 58.28□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 31.4
PRPF8Q6P2Q9 TOR1AIP1-210ENST00000531630 579 ntTSL 57.58□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 31.4
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PRPF8Q6P2Q9 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.632e-7■■■■■ 31.4
PRPF8Q6P2Q9 TADA2A-211ENST00000620086 1096 ntTSL 54.18□□□□□ -1.749e-8■■■■■ 31.4
PRPF8Q6P2Q9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.284e-8■■■■■ 31.4
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PRPF8Q6P2Q9 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.416e-7■■■■■ 31.4
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PRPF8Q6P2Q9 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 31.4
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PRPF8Q6P2Q9 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.228e-7■■■■■ 31.4
PRPF8Q6P2Q9 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.58e-7■■■■■ 31.4
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PRPF8Q6P2Q9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 31.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.329e-8■■■■■ 31.4
PRPF8Q6P2Q9 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.059e-7■■■■■ 31.4
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PRPF8Q6P2Q9 KIAA0141-202ENST00000432126 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -17e-7■■■■■ 31.3
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PRPF8Q6P2Q9 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 31.3
PRPF8Q6P2Q9 MTCH1-205ENST00000471737 629 ntTSL 210.93□□□□□ -0.668e-15■■■■■ 31.3
PRPF8Q6P2Q9 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.452e-10■■■■■ 31.3
PRPF8Q6P2Q9 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.492e-10■■■■■ 31.3
PRPF8Q6P2Q9 NT5C2-201ENST00000343289 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.236e-7■■■■■ 31.3
PRPF8Q6P2Q9 NT5C2-202ENST00000369857 2625 ntTSL 25.04□□□□□ -1.66e-7■■■■■ 31.3
PRPF8Q6P2Q9 BEND7-205ENST00000466271 990 ntTSL 523.51■■□□□ 1.351e-13■■■■■ 31.3
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PRPF8Q6P2Q9 TTLL4-207ENST00000434241 476 ntTSL 56.81□□□□□ -1.321e-9■■■■■ 31.3
PRPF8Q6P2Q9 REV3L-211ENST00000470871 386 ntTSL 31.61□□□□□ -2.153e-6■■■■■ 31.3
PRPF8Q6P2Q9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 31.3
PRPF8Q6P2Q9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 31.3
PRPF8Q6P2Q9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 31.3
PRPF8Q6P2Q9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 31.3
PRPF8Q6P2Q9 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 31.3
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