Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CARMIL1Q5VZK9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CARMIL1Q5VZK9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms