Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPF38BQ5VTL8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PRPF38BQ5VTL8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms