Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GKAP1Q5VSY0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms