Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PXDC1Q5TGL8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms