Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COLEC12Q5KU26 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COLEC12Q5KU26 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms