Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ANKRD39Q53RE8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ANKRD39Q53RE8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms