Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms