Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms