Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RRN3P1Q2M238 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms