Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM187BQ17R55 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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